Az 1945-ben a Jugend Eupen és az FC Eupen 1920 összeolvadásával megalakult AS Eupen története nagy részben az alsóbb osztályokban szerepelt.[2] A belga negyed-, harmad- és másodosztályban szerepelt komolyabb eredmények nélkül. 2010-ben feljutottak a belga élvonalba. Ez nemcsak az Eupen, hanem a belga futball történetében is újdonságot jelentett. Az országos bajnokság közel 120 éves történetében először jutott a legmagasabb osztályba német nyelvű település csapata.
A Danny Ost vezetőedző irányította Eupen az első élvonalbeli mérkőzésén vezetést szerzett az RSC Anderlecht otthonában, de kikapott 4–1-re, majd vereségek hosszú sora következett. A 10. fordulóig egy ponttal szerénykedett a csapat, hogy aztán 6–0-ra legyőzze a Sint-Truident.[3] A csapat formája javult, ám ez sem bizonyult elégnek, a klub a 13. pozíciónál egyszer sem álltak jobban a tabellán, a 15. helyen végzett, ami osztályozott és végül kiesést jelentett.
2012-ben új befektetőjelöltek bukkantak fel a klubnál. Katari küldöttség érkezett, amely meg is vette a klubot.[4] Az új tulajdonosok az Eupen profi futballszakosztályának irányítását vették át, a klub többi szakosztálya maradt helyi kézben. Az Eupen utánpótláscsapatai szintén kapnak pénzügyi támogatást Katarból, ám a szakmai munkába nem szólnak bele a befektetők. A vásárlók a katari Aspire Zone Foundation (AZF) képviselői voltak.[5] A katari hatalomátvétel utáni első évben a klub elküldte a régi keret meghatározó labdarúgóinak nagy részét. Az újonnan érkező vezetőedző, Tintín Márquez a katari tulajdonosok útmutatását követve járt el, maradtak helyi futballisták, ám a főszerepet a Dohából érkező fiatalok kapták. A 2012–2013-as idényben az Eupen a belga másodosztály 8. helyén végzett, majd kétszer egymás után osztályozón maradt le az élvonalbeli szereplésről. A 2015–2016-os bajnoki 2. hely feljutást ért, miután a Royal White Star Bruxelles nem kapta meg az első osztályhoz szükséges licencet.[6]
Bernd Storck
