Egy kis csőrcsont, amely a felső [[felső állcsont|felső állkapocs]] végén van, útalutal arra, hogy a dinoszaurusz egy ceratopsia, bár a koponyája tetején van egy dudor, amely a [[pachycephalosauria|pachycephalosauriákra]] jellemző. Ennek a dúdornak a jelenléte, bizonyítja a pachycephalosauriák és ceratopsiák együtt helyezését, a [[Marginocephalia]] csoportba, bár a ceratopsiák a Yinlongon kívül elvesztették ezt a dudort. A Yinlong a [[Heterodontosauridae]] családdal is mutat hasonlóságot, ezzel rokonságba hozva a Heterodontosauridae családot a Marginocephalia csoporttal. A nagy csoport amelyben a két rokon ág van, a [[Heterodontosauriformes]] nevet kapta.
