A szabad szemmel látható jellegeken túl felhasználhatók példáulfelhasználhatóak molekuláris és [[genetika]]i vizsgálatok is. A [[növény]]ekkel kapcsolatos kutatások például az utóbbi egy-két évtizedben új lendületet kaptak az olyan új eljárársokeljárások egyre elterjedtebb alkalmazásának következtében, mint a [[kromatográfia]], vagy az [[elektroforézis]] egyre elterjedtebb alkalmazásának hatására az utóbbi egy-két évtizedben új lendületet kaptak. A ''szekunder metabolitok'', azaz a növények másodlagos anyagcseretermékei például (pigmentek, olajok, viaszok) is fontos és új információkat jelentenek a taxonómus számára (kemotaxonómia). A [[DNS]], vagy az [[RNS]] vizsgálata elvileg ugyan feleslegessé tesz bármilyen más jellegű vizsgálatot, hiszen az örökítőanyag közvetlen vizsgálatát teszi lehetővé, ám a vizsgálatok költségesek, az eredmények pedig érdekes anomáliákat hordozhatnak.
