FeleségétFelesége Margaretnek[[Margarete hívtákBoden]], akivel egy üdülőhelyen ismerkedtek össze. Természetesen aranyszőke volt és kék szemű, bár Himmlernél nyolc évvel idősebb. 1928 nyarán házasodtak össze. Két gyermeket neveltek. Csak az egyikük volt vér szerinti: lányuk, [[Gudrun Himmler]], akit a családban csak kiskutyának''„kiskutyának” (Püppi)'' hívtak. Mivel Margónak nem születhetett több gyermeke, örökbe fogadtak egy kisfiút, akit -– Gudrunnal együtt -– felneveltek. Családi élete sem volt rendben: a Reichsführer szeretőjévé tette a titkárnőjét, Hedwig Potthastot, aki két gyermeket szült neki. Gudrun a háború után férjhez ment egy újságíróhoz és felvette annak vezetéknevét (Burwitz). Apjához hasonló nézeteket vallva, aktív [[neonáci]] tevékenységet folytatott.