Édesapja '''Ferdinánd''' (1433. szeptembernovember 1817. – 1470. novemberszeptember 1718.), Viseu második hercege és Beja első hercege, 6º Condestável de Portugal <ref>A condestável tulajdonképpen a Portugál Királyság összes haderejének a főparancsnoka volt; a szám pedig azt jelöli, hányadik ebben a tisztségben, a tisztség létrehozása óta.</ref>. Ferdinánd herceg '''[[I. Duarte portugál király|I. ''Ékesszóló'' Eduárd]]''' (1391 - 1438) királynak a fia; '''[[I. János portugál király|I. ''Jó'' János]]''' (1357 - 1433) királynak, az Avis-ház alapítójának, az unokája, és '''[[V. Alfonz portugál király|V. ''Afrikai'' Alfonz]]''' (1432 - 1481) királynak az öccse. I. Mánuel édesanyja (Ferdinánd herceg felesége) Beatrix (1430 - 1506) hercegné volt, János (1400 - 1442) infáns (I. János király – házasságából született – ötödik fia, 3º Condestável de Portugal), és felesége, Bragança Izabella (1402 - 1465) hercegné leánya.
