Az '''[[FC Bayern München]] sportegyesületének női labdarúgócsapata''' 1970-ben alapult meg. Az 1970-es évek során az első fénykorát élte a csapat. 1972-től 1990-ig egymást követő 19 alkalommal nyerték meg a bajor bajnokságot, míg 1976-ban német bajnoki címet ünneplehettek a Tennis Borussia Berlin felett hosszabbítás során 4–2 arányban aratott győzelemmel, míg 1975-ben, 1979-ben, 1982-ben és 1985-ben alul maradtak a bajnoki döntők során, valamint 1988-ban és 1990-ben a német kupa döntőjéig jutottak.
1990-ben az átszerveződő német bajnokság, a pontrednszer elvén működő Bundesliga egyik alapító tagja, majd 1992-ben visszaesnek a másodosztályt képző a Bayernligaba. Újra az első osztályba 2000-ben jutott fel a csapat. A 2008–2009-es szezon során csupán egy lőtt gólon múlt a bajnoki cím, de a következő szezonban a klub története során első alkalommal szerepelhettek nemzetközi szinten az UEFA Női Bajnokok Ligájában, ahol a legjobb 16 csapat közzé jutottak be. 2012-ben történetük során először nyerték meg a Némert Kupát az [[1. FFC Frankfurt]] 2–0 arányú legyőzésével.
2015-ben a klub története során második alkalommal német bajnoki címet ünnepelhetett a csapat.
