Nehéz évek következtek a klub számára, 1991-ben csak nagy szerencsével nem estek ki, majd 1993-ban tök utolsóként zártak és a harmadosztályba kerültek. A zuhanás itt nem állt meg, az anyagi gondokkal küzdő klub 1998-ban már a negyedosztályban találta magát. A következő években a klub csak kisebb tartományi sikereket tudott felmutatni, aztán 2004-ben a korábbi Darmstadt-játékos [[Bruno Labaddia]] irányításával sikerült feljutniuk a harmadosztályba, ahol két szezont is töltöttek. 2008-ban a felhalmozott adósságok miatt szóba került az egyesület feloszlatása is, végül az adományok és egy-két jótékonysági mérkőzés megmentette a klubot a széthullástól.<br>
Végül 2011-ben ismét ráléptek a sikerek útjára és saját csoportjukat megnyerve feljutottak a mostmármost már egységes harmadosztályba ([[Német labdarúgó-bajnokság (harmadosztály)|3. Liga]]). Itt két szezont töltöttek a tabella hátsó részében, 2013-ban csak nagy szerencsével nem estek ki. A 2013/14-es idényben azonban hatalmas meglepetésre a harmadik helyen zártak, így az [[Arminia Bielefeld]] együttesével játszhattak osztályozót a másodosztályért. A rendkívül látványos és emlékezetes párharc során a liliomok először otthon kikaptak 1:3-ra, majd [[Bielefeld|Bielefeldben]]ben a 122. percben lőtt mindent eldöntő góllal 4:2-re nyertek és idegenben lőtt több góllal feljutottak a [[Német labdarúgó-bajnokság (másodosztály)|2. Bundesligába]].<ref>{{cite web | url = http://www.kicker.de/news/fussball/2bundesliga/relegation-abstieg/2-bundesliga-relegation-fb-1/2013-14/0/0/spieltag.html |publisher= Kicker.de | title = A 2013/14-es 2. Bundesliga osztályozó |accessdate=2015-9-17 |language=német}}</ref> A tündérmese a következő idényben is folytatódott, a liliomok mindössze egy ponttal megelőzve a [[Karlsruher SC]]-t a második helyen zártak és automatikusan feljutottak az első osztályba.<ref>{{cite web | url = http://www.sv98.de/home/verein/ueber-uns/der-verein/ |publisher= sv98.de | title = A csapat története a klub hivatalos oldalán |accessdate=2015-9-17 |language=német}}</ref>
