Srna [[2002]] óta a [[horvát labdarúgó-válogatott|horvát válogatott]] tagja. Részt vett a [[2004-es labdarúgó-Európa-bajnokság|2004-es Európa-bajnokságon]], ahol két mérkőzésen játszott. Két évvel később ott volt a [[németország]]i [[2006-os labdarúgó-világbajnokság|világbajnokságon]]. Horvátország mindhárom mérkőzésén pályára lépett. [[Japán labdarúgó-válogatott|Japán]] ellen [[tizenegyes|büntetőt]] hibázott, ami miatt erősen kritizálták, de az [[Ausztrál labdarúgó-válogatott|Ausztrália]] elleni mérkőzés után már megváltozott a véleményük a szurkolóknak, miután közel 30 méterről gólt szerzett a 2. percben.
Srna benne volt a [[2008-as labdarúgó-Európa-bajnokság|2008-as EBEb]] 23 fős horvát keretében. [[júniusJúnius 12.|Június 12-én]] a [[Német labdarúgó-válogatott|Németország]] elleni csoportmérkőzésen szerzett gólt a 24. percben. Ez volt az első gólja a kiírásban, egyben a meccs első találata is. Horvátország 2–1-re nyerte a mérkőzést. Srna volt az egyetlen játékos, aki a [[Török labdarúgó-válogatott|Törökország]] elleni negyeddöntőben belőtte a tizenegyespárbaj során a saját büntetőjét. A horvátok 3–1-re veszítették el a tizenegyespárbajt, ezzel kiestek a kiírásból.<ref>[https://www.{{youtube.com/watch?v=|h9x6tB8_maU|A Videóbüntetők}} a(szerzőijog-sértés büntetőkről]miatt youtube.comeltávolítva)</ref> A [[2012-es labdarúgó-Európa-bajnokság|2012-es Európa-bajnokság]] és a brazíliai [[2014-es labdarúgó-világbajnokság|világbajnokság]] alatt is ő volt a csapatkapitány, de mindkét tornán a csoportkör után búcsúztak. 100. válogatott meccsét [[Dél-afrikai labdarúgó-válogatott|Dél-Afrika]] ellen játszotta 2013. február 6-án.
A [[2012-es labdarúgó Európa-bajnokság|2012-es Európa-bajnokság]], és a brazíliai [[2014-es labdarúgó-világbajnokság|világbajnokság]] alatt is ő volt a csapatkapitány, de mindkét tornán a csoportkör után búcsúztak.100.válogatott meccsét Dél:Afika ellen játszotta 2013. február 6-án.
