Szathmári Paksi Mihály lelkész és tanár és Ember JudithJudit (Ember Pál író leánya) fia. Marosvásárhelyt született, ahol tanulását kezdte és 1734-től [[Sárospatak]]on folytatta. [[1740]]. [[december 9.|december 9-én]] az [[Frankfurt (Oder)|odera-frankfurti]], [[1741]]. [[december 16.|december 16-án]] a [[franeker]]i egyetemre iratkozott be, ahol neve Stephanus Szathmárinak van bejegyezve. 1745-ben [[aszaló]]i (Abaúj-Torna megye) lelkész lett, ahol feleségül vette a [[miskolc]]i Óvári Máriát. 1747-ben tanár lett [[Debrecen]]ben, ahol történelmet, latint s [[ógörög nyelv]]et és irodalmat tanított; 1760-ban áthelyezték a hittani tanszékre, ahol már előbb is több évig helyettesített. 1762-ben egyházkerületi jegyző lett, [[1785]]. [[október 11.|október 11-én]] pedig püspökké választották, mely hivatalát együtt folytatta a tanársággal, de erről [[1790]]. [[január 18.|január 18-án]] lemondott.