Horvátország függetlenné válásakor a vallási felekezeteknek újra kellett szervezniük az egyházaikat.
A Horvátországi Református Keresztyén Egyház 1993. február 24-én került bejegyzésre az Eszék melletti Rétfaluban. Első püspöke Lángh Endre vinkovci lelkész lett. 1999. június 12-én a III. országos zsinaton [[Kopács]]on felvette [['''Horvátországi Magyar Református Keresztyén Egyház]]''' nevet, amely vezetőjének Kopácsi Kettős Jánost választották meg.<ref>{{cite web |url=http://magyaridok.hu/kulfold/uj-puspokot-valasztottak-horvatorszagi-reformatus-egyhaz-elere-2444548/ |title=ÚJ PÜSPÖKÖT VÁLASZTOTTAK A HORVÁTORSZÁGI REFORMÁTUS EGYHÁZ ÉLÉRE |work=magyaridok.hu |accessdate=2018-01-25}}</ref><ref>{{cite web |url=http://www.reformatus.hr/uncategorized/a-horvatorszagi-reformatus-egyhazak-allami-kozigazgatasi-tortenete-1993-2015/ |title=A horvátországi református egyházak állami közigazgatási története |archiveurl=https://web.archive.org/web/20171019040732/http://www.reformatus.hr/uncategorized/a-horvatorszagi-reformatus-egyhazak-allami-kozigazgatasi-tortenete-1993-2015/ |archivedate=2017-10-19 |language= magyar}}</ref>
