Polgári származású családban született. Apja, [[Magyar Bálint (színháztörténész)|Magyar Bálint]] ([[1910]]-–[[1992]]) film- és színháztörténész, színházigazgató, anyja, a [[kolozsvár]]i zsidó származású [[Siklós Olga]] ([[1926]]-–[[2006]]) dramaturg ([[1947]]-ig Schwarcz) volt. Apai nagyszülei [[Magyar Elek]] ([[1875]]-–[[1947]])<ref>Az „Inyesmester”.</ref> lapszerkesztő, újságíró, és a nemesi származású fajkürthi és kolthai Kürthy Berta ([[1884]]–[[1915]]) voltak.<ref name="magyareleknékürthy">{{Cite web|url=https://familysearch.org/ark:/61903/3:1:S3HY-695S-198?mode=g&i=930&wc=M6WV-JNG%3A101521201%2C101521202&cc=1542666|title=familysearch.org Magyar Elekné Kürthy Bertha gyászjelentése}}</ref> Kürthy Bertha nagyapja, szemerei [[Szemere Bertalan]] ([[1812]]-–[[1869]]) miniszterelnök volt.<ref>Gulyás Pál: Magyar írók élete és munkái XVII.kötet, Budapest, 1995, {{ISBN|963-446-012-7}}</ref> Anyai nagyszülei Schwarcz Dezső és Klein Róza voltak, akik [[1928]]-ban [[Budapest]]re költöztek. Édesanyja sárga csillagos képét mindig magánál hordja. Egy interjúban felidézte, hogy vállalja [[zsidók|zsidós]]ágát, ha „olyan helyzetbe kerül”.<ref>[http://www.csepeli.com/kotet/csepeli60_magyar_balint.pdf Magyar Bálint: A mi történetünk], Csepeli György honlapja, {{PDF}}</ref> Egy testvére van, [[Magyar Fruzsina]] dramaturg, [[Mécs Imre]] országgyűlési képviselő felesége. Nős, [[1993]] óta felesége [[Hodosán Róza]] szociológus, korábban [[Szabad Demokraták Szövetsége|SZDSZ]]-es országgyűlési képviselő. Egy gyermek édesapja, Annamária lánya 1993-ban született.
