„Mitokondriális Éva” változatai közötti eltérés

[[Gén]]jeink messze túlnyomó többségét a [[sejtmag]]okban lévő [[kromoszóma|kromoszómák]] DNS-e hordozza. E gének leszármazása nem kizárólag (vagy nem dominánsan) anyai ágon zajlik. Az emberiségnek e számos gén leszármazása alapján számos különböző „legutolsó közös őse” lehet, de ezek nem azonosíthatók, hiszen e gének az ivaros szaporodásban rekombinálódnak: 2 szülő, 4 nagyszülő, 8 dédszülő stb. génjeinek véletlenszerű kombinációját örököljük. Az elmélet súlyos hiányossága, hogy nem ad magyarázatot arra a tényre, hogy például neandervölgyi kromoszómája nem minden ma élő embernek van. Ezen tény alapján léteznie kellett volna egy olyan mitokondriális Emesének is, aki semmiféle rokonságban nem volt a mitokondriális Évával.