„SMILES” változatai közötti eltérés

[ellenőrzött változat][ellenőrzött változat]
Tartalom törölve Tartalom hozzáadva
Átfogalmazás: a SMILES az algoritmus, nem az algoritmus eredménye; formázott (wikitable) táblázatok; <tt> helyett <code>; angol link törölve
kisebb javítások
11. sor:
* az atom töltése, pl. <code><nowiki>[H+]</nowiki></code> a proton, <code><nowiki>[Fe++]</nowiki></code> vagy <code><nowiki>[Fe+2]</nowiki></code> a vas(II)-ion,
* az izotóp, pl. <code><nowiki>[2H]</nowiki></code> a [[deutérium]],
* megadhatók az atomhoz kapcsolódó hidrogénatomok, pl. <code><nowiki>[NH3]</nowiki></code> az [[ammónia]], <code><nowiki>[OH-]</nowiki></code> a hidroxil-anionhidroxidion kódja.
 
=== A hidrogénatom ===
42. sor:
|}
 
A szerves kémiában a képletek egyszerűsítése végett a hidrogénatomokat sokszor nem tüntetik fel. Ezt a gyakorlatot a SMILES is átvette. A szerves kémiában gyakori atomok szögletes zárójel nélkül írhatók. Az atomot ilyenkor hidrogénatomokkal a kémiai kötések figyelembe vételével a legkisebb „szabályos” vegyértékűre egészítjükegészítik ki.
 
Példák:
77. sor:
Az egyes kötés jele: <code>-</code>, a kettesé <code>=</code>, a hármasé <code>#</code>, az aromásé <code>:</code>. Az egyes és aromás kötés jele elhagyható, és a gyakorlatban nem is használják őket.
 
Példák (az etánt 4 féle képpennégyféleképp is lehet írni):
 
{| class="wikitable"
93. sor:
| C=O || HCHO
|-
| [[etilénetén]]
| C=C || CH<sub>2</sub>=CH<sub>2</sub>
|-
105. sor:
| C#N || HCN
|-
| [[Etanol|etil-alkohol]]
| CCO || CH<sub>3</sub>—CH<sub>2</sub>—OH
|-
115. sor:
 
== Elágazó láncok ==
Az oldalláncot zárójellel jelöljükjelölik az után az atom után, amelyikből elágazik. A főlánc az (utolsó) oldallánc záró zárójele után folytatódik. A SMILES nem írja elő, melyik láncot tekintjük fő- ill. oldalláncnak. A lánc nem feltétlenül tartalmaz szénatomot. Az oldalláncban újabb oldallánc(ok) lehet(nek) (egymásba ágyazott zárójelezés).
 
Példák:
125. sor:
 
== Gyűrűs vegyületek ==
[[file:SMILES.png|frame|jobbra|Egy bonyolultabb molekula SMILES-kódja. A: az eredeti képlet. B: a gyűrűzáró élek és címkézésük. C: zölddel jelölve a főlánc, a többi színnel az oldalláncok. D: a SMILES-kód, színekkel jelölve a hozzájuk tartozó részlet.]]
 
[[Fájl:Cyclopropane-skeletal.png|bélyegkép|balra|75px|[[Ciklopropán]]<br>C1CC1]]
 
SMILES-ban nyílt vegyületeknél új kémiai kötést mindig egy új atommal együtt adunkadják meg. Gyűrű lezárásakor egy új és egy korábban már előfordult atom között kell megadni kötést. Az ilyen atomokat megcímkézzükmegcímkézik. Ugyanaz a címke pontosan kétszer kell szerepeljen: a második előfordulás a gyűrűzárás.
 
A címke egy természetes szám. Az 1–9 közötti címkét közvetlenül a vegyjel után írjukírják. Például a ciklopropán SMILES-kódja <code>C1CC1</code>. Az 1-es címke adja meg az első és harmadik szénatom közötti kötést.
 
Hasonlóan a [[ciklohexán]] SMILES-kódja <code>C1CCCCC1</code>.
 
{{anchor|aromás}}Aromás vegyületek megadhatók váltakozó kettőskötésekkel (Kekulé-alak), vagy úgy, hogy az aromás gyűrű atomjaitatomjainak kisbetűkkelkisbetűs írjukírásával:
 
<gallery>
A lap eredeti címe: „https://hu.wikipedia.org/wiki/SMILES