A tenyésztés a második generáció óta fontos része a "''Pokémon"''nak. Így lehet megszerezni a baba pokémonokat, mint például Pichu-t, aki olyan támadásokat tanulhat meg, amit Pikachu-ként vagy Raichu-ként hasznosítani tud a csatákban. A pokémonok tenyésztéséhez el kell menni a Pokémon Nevelőközpontba (Pokémon Day-Care Center), és ott oda kell adni megőrzésre két egymással tenyészthető (értelemszerűen egy hím és egy nőstény) pokémont. Egy idő után a központ vezetője talál egy tojást, és odaadja a játékosnak. A tojás egy baba pokémont rejt. A tojás kitörése után a pokémon a negyedik generációig 5-ös szintű, a negyedik generációtól kezdve azonban 1-es szintű. A baba pokémon az anyjának fajába tartozik, de ismeri az apja egyes támadásait. Bizonyos pokémonok tenyésztés útján olyan támadásokat tanulhatnak, amelyet szintlépés útján nem tanulhatnak meg. Például egy nőstény Psyduck-nak és egy hím Girafarig-nak olyan Psyduck-ja születik, amely tudja a Pszichokinézist (Psychic), ha a Girafarig ismeri ezt a lépést.
Vannak a tenyésztéshez hasznos szelencék is, amelyek segítségével egy pokémon tojásából egy új faj kel ki. Ilyen például a Full Incense, amelynek a segítségével a Snorlax tojásából nem Snorlax, hanem Munchlax kel ki. A tenyésztéshez hasznos lehet egy másik tárgy is, a Light Ball, amelynek segítségével Pichu megtanulhat egy új, egyedi támadást. Az a Pichu, amelynek anyjánál van egy ilyen tárgy, ismerni fogja a Volt Öklelés (Volt Tackle) támadást, amikor kikel a tojásból.
