Igazán egyéni és jellegzetes művészete a [[arckép]]festésben mutatkozott meg. Híressé vált [[Habsburg–Estei Mária Ludovika főhercegnőmagyar királyné|Mária Ludovika császárnéról]] ([[I. Ferenc magyar király|Ferenc császár]] harmadik feleségéről) készített képmása, és az [[EszterházyEsterházy család]] egyes tagjairól készített [[miniatúra|miniatúrái]]. Mária Ludovika képmását a [[Szépművészeti Múzeum]], [[Batsányi János]] képmását a [[Magyar Nemzeti Múzeum]] őrzi. Miniatúráit angol minták után festi, de teljesen egyéni felfogásban és sajátságos bájjal idézi fel a letűnt [[rokokó]] világot, [[elefántcsont]]ra, [[pergamen]]re festett színes portréi az üdeség, az [[optimizmus]] benyomását keltik. Füger kiváló mester volt, kedvelt műfajában, a portréfestésben tűnt ki leginkább.