[[Fájl:Puerto Rican shrew.jpg|250px|bélyegkép|A sajnos már kihalt ''[[Nesophontes edithae]]'' egy puerto ricó-i rovarevő volt.]]
A szigeten már az őshonos szárazföldi emlősök kipusztultak, például a ''[[Nesophontes edithae]]'', a [[puertoPuerto ricóRicó-i hutia]] ''(Isolobodon portoricensis)'' és a [[tüskéspatkányfélék]] ''(Echimyidae)'' család néhány faja (''[[Heteropsomys antillensis]]'', ''[[Heteropsomys insulans]]'', ''[[Puertoricomys corozalus]]'') és egy kihalt antillai rágcsálócsalád a ''[[Heptaxodontidae]]'' egy faja a ''[[Elasmodontomys obliquus]]''. A szigeten fennmaradtak a [[denevérek]], ezek a [[nagy nyúlszájú denevér]], az [[antillai szellemdenevér]], a [[Parnell bajszos denevére]], a [[kormos bajuszos denevér]], a [[jamaicai gyümölcsdenevér]], az [[antillai gyümölcsdenevér]], a [[barna virágdenevér]], [[Leach denevére]], a [[piros gyümölcsdenevér]], a [[barna késeidenevér]], a [[vörös szőrösfarkú-denevér]], a [[vörös szőrösfarkú-denevér]], a [[pallas-szelindekdenevér]], és a [[mexikói szelindekdenevér]]. A [[Puerto Ricó-i hutia]] valójában [[Hispaniola]] ([[Haiti]] és a [[Dominikai Köztársaság]]) szigetén volt őshonos, a [[Taíno]] indiánok telepítették be [[Puerto Rico]] szigetére. A puerto-ricó-i vizek gyengéd óriása a [[karibi manátusz]] ''(Trichechus manatus)''. A [[hosszúszárnyú bálna]] ''(Megaptera novaeangliae)'' téli szaporodó helye az [[északi félgömb]]ön van, még a [[Karib-tenger]]ben is szaporodik.
[[Image:Rhesus Macaques.jpg|thumb|left|200px|A [[rhesusmajom]] ''(Macaca mulatta)'' Puerto Ricó-ban betelepített állat.]]
Élnek itt betelepített emlősök, mint például a [[jávai mongúz]] ''(Herpestes javanicus)'' melyet azért telepítették be, hogy a [[cukornád]] ültetvényeken a [[patkány]]okat kiirtsa. Ez a faj elszaporodott és mára már a helyi állatvilágot fenyegeti. A [[rhesusmajom|rhesus majmot]] ''(Macaca mulatta)'' kutatási célokból telepítették be a szigetre. A rhesus majmok ellopják a [[fehérhasú szula|fehérhasú szulák]] tojásait és ezért jelentenek veszélyt más fajokra.
