Az International Code of Phylogenetic Nomenclature, ismertebb rövidítése szerint PhyloCode, egy fejlődő szabványjavaslat a filogenetikus rendszertanban használt nevek szabályozására. Jelenlegi változata a kládok elnevezésének szabályozására tesz kísérletet, a fajok neveinek meghatározását meghagyva más szabályozók (ICBN, ICZN, ICNB) kezében.

A PhyloCode fejlesztését az International Society for Phylogenetic Nomenclature (ISPN)[1] felügyeli.

Áttekintés szerkesztés

A PhyloCode célja a filogenetikus rendszertan szabályozása azáltal, hogy szabályokat állít fel arra nézve, hogy az elnevezések és definíciók közül melyeket tekintenek megalapozottnak,[2] melyeket homonimáknak[3] vagy szinonimáknak,[4] és a homonimák vagy szinonimák csoportjai közül melyek lesznek elfogadottak (általában az előbb regisztráltak; lásd alant).

A PhyloCode kizárólag kládok elnevezését fogja megengedni,[5] tehát parafiletikus vagy polifiletikus csoportokét nem, a specimenek (példányok), fajok és apomorfiák használatát fogja a kládot meghatározó tényezőkként (horgany, anchor) engedélyezni.[6]

Filogenetikus rendszertan szerkesztés

A korábbi, rangokon alapuló nevezéktanokkal (ICBN, ICZN, ICNB) ellentétben a PhyloCode nem követeli meg a rendszertani rangok használatát, bár opcionálisan megengedi azt.[7][8] A hagyományos rendszertanok a taxonokat rangok (mint pl. génusz, család stb.) segítségével, és sok esetben típuspéldány vagy típus-altaxon segítségével. A típuson kívül a taxon pontos tartalmát a rangokon alapuló rendszertanok egyáltalán nem definiálják.

Ezzel ellentétben, a filogenetikus rendszertan egy-egy taxon tartalmát a leszármazási kapcsolatok alapján határozza meg, az egyes élőlényekre pedig „specifierek” (meghatározók) alapján hivatkozik. A specifierek lehetnek specimenek (példányok), fajok és apomorfiák. A definíciós formula egy őst határoz meg. A leírt taxon ezzel az őssel, és annak valamennyi leszármazottjának összességével egyezik meg. Tehát adott filogenetikus taxon meghatározása annak a taxonnak a leszármazását leíró elméleten alapul.

A következőkben tekintsünk néhány példát a filogenetikus taxonleírásra (a nagybetűk 'meghatározók'ra utalnak):[9]

  • Csomópont-alapú (Node-based): „az A és B legfiatalabb közös őséből kiinduló klád” vagy „az A-t és B-t tartalmazó kládok közül a lehető legkisebb”
  • Ág-alapú (Branch-based): „a klád, ami tartalmazza A-t és minden élőlényt vagy fajt, amivel Z-nél fiatalabb közös őse van A-nak” vagy „a lehető legnagyobb klád, ami A-t tartalmazza, de Z-t nem”
  • Apomorfia-alapú (Apomorphy-based): „az első, A-ban is meglévő M apomorfiát tartalmazó élőlényből vagy fajból kiinduló klád” vagy „a lehető legnagyobb, az M jegyet mutató klád, ami A-val szünapomorf”

Egyéb definíciótípusok is lehetségesek.

Az alábbi táblázat példázza a rang alapú és a leszármazási alapú definíciók különbségeit.

Név Rang Típus Lehetséges filogenetikus meghatározás
Tyrannosauridae Család Tyrannosaurus Osborn 1905 a legkisebb, a Tyrannosaurus rex-et Osborn 1905, a Gorgosaurus libratus-t Lambe 1914 és az Albertosaurus sarcophagus-t Osborn 1905 is tartalmazó klád
Mammalia Osztály N/A a Homo sapiens Linnaeus 1758 és a Ornithorhynchus anatinus Blumenbach 1800 legfiatalabb közös ősétől induló klád

Fordítás szerkesztés

  • Ez a szócikk részben vagy egészben a PhyloCode című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

Jegyzetek szerkesztés

  1. International Society for Phylogenetic Nomenclature (website)
  2. International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b – Chapter II. Publication. [2008. december 28-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)
  3. International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b – Article 13: Homonymy. [2008. december 28-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)
  4. International Code of Phylogenetic Nomenclature Version 4b, Article 14: Synonymy. [2008. december 27-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)
  5. International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b – Rule 1.1. [2008. október 15-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)
  6. International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b – Article 11. Specifiers and Qualifying Clauses. [2008. november 3-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)
  7. International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b – Article 3. Hierarchy and Rank. [2008. október 15-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)
  8. Bár azzal az eltéréssel, hogy a PhyloCode nem engedélyezi a taxon nevének megváltozását, ha rendszertani rangjában változás állna be, míg a hagyományos rendszertanban ezt gyakran megkövetelik.
  9. International Code of Phylogenetic Nomenclature, Version 4b – Article 9. General Requirements for Establishment of Clade Names. [2008. október 15-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2008. október 23.)