CRY1
A CRY1 a Cryptophyta egy 2024-ig tenyésztetlen[1] plasztisz nélküli környezeti taxonja ideiglenes neve.[2]
CRY1 | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Rendszertani besorolás | ||||||||||||||
|
Történet
szerkesztésMivel a legtöbb Cryptophyta-faj foto- vagy mixotróf, a CRY1 kládot és más heterotróf, potenciálisan bakterivor kládokat nagyrészt figyelmen kívül hagyták, azonban más, nem a CRY1-hez tartozó, de a CryptB általános Cryptophyta-teszt által célzott sejtek száma igen magas, 70%-os relatív gyakoriságuk és magas sejtspecifikus felvételi sebességük alapján további bakterivor kládjai lehetnek.[3]
Első környezeti fajait 2008-ban fedezték fel Shalchian-Tabrizi et al.[4]
Első ténylegesen, vagyis nem csak környezeti DNS-ből felfedezett faja a Hemiarma marina, melyet Shiratori et al. fedeztek fel 2016-ban.[4]
Élőhely
szerkesztésElőfordul az epi-, a meta- és a hipolimnionban. Leggyakoribb (1600 sejt/ml) az epi-, ritkább (1100 sejt/ml) a meta-, legritkább (<600 sejt/ml) a hipolimnionban.[5] Édesvíziek.[5]
Az egyik leggyakoribb bakterivor ostorosok.[6]
Életmód
szerkesztésA Cryptophyta sok tagjával ellentétben plasztisz nélküli fagotróf bakterivor fajok tartoznak ide.[6] Növekedését jelentősen stimulálja egy Limnohabitans-faj Rim11 törzse.[3]
Morfológia
szerkesztésA Cryptophyceae taxonhoz hasonló jellemzői például a lapos mitokondriális cristák, a sejtfedő periplaszt és a két egymásra tekert szalagból álló ejektoszómák.[4]
Mozgás
szerkesztésA Hemiarma marina helyváltoztató mozgása ugró mozgás, ezenkívül nagyon gyorsan foroghat.[4]:S1, S2
Filogenetika
szerkesztésTagjai bazális helyzetűek a Cryptophyceae csoporthoz képest,[7] de a bakterivor Cryptista-fajoknak koronacsoportját alkotják.[6] Feltehetően a plasztisszal rendelkező csoport testvércsoportja.[8]
Monofiletikus csoport, mely az amplikonszekvenálási adatokban kevésbé van jelen, mint azonos minták FISH-adataiban.[9]
Genomika
szerkesztésCry1-652 teszttel szinte csak a CRY1-be tartozó élőlények mutathatók ki, de azok nagy része kimutatható.[6]
CARD-FISH és környezetiszekvencia-elemzések alapján a plasztisz nélküli bakterivor Cryptophyta-fajok, például a CRY1-fajok is, számos trofikus állapotú tóban megélnek.[6]
Jelentőség
szerkesztésA bakterivor Cryptophyta-fajok fontosak a szerves anyagok magasabb trofikus szintekbe való juttatásához.[3]
Jegyzetek
szerkesztés- ↑ Kavagutti VS, Bulzu PA, Chiriac CM, Salcher MM, Mukherjee I, Shabarova T, Grujčić V, Mehrshad M, Kasalický V, Andrei AS, Jezberová J, Seďa J, Rychtecký P, Znachor P, Šimek K, Ghai R (2023. január 26.). „High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom”. Microbiome 11, 15. o. DOI:10.1186/s40168-022-01451-4. PMID 36698172. PMC 9878933.
- ↑ Grujcic V, Nuy JK, Salcher MM, Shabarova T, Kasalicky V, Boenigk J, Jensen M, Simek K (2018. február 20.). „Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton”. ISME J 12 (7), 1668–1681. o. DOI:10.1038/s41396-018-0057-5. PMID 29463895. PMC 6018765.
- ↑ a b c Grujčić V, Nuy J, Salcher M, Shabarova T, Kasalický V, Boenigk J, Jensen M, Šimek K (2018. február 20.). „Cryptophyta as major bacterivores in freshwater summer plankton”. ISME J, Oxford, 89. o, Kiadó: Oxford University Press; Springer. (Hozzáférés: 2024. július 31.)
- ↑ a b c d Shiratori T, Ishida K. „A new heterotrophic cryptomonad: Hemiarma marina n. g., n. sp.”. J Eukaryot Microbiol. (Hozzáférés: 2024. július 30.)
- ↑ a b Mukherjee I, Grujčić V, Salcher MM, Znachor P, Seďa J, Devetter M, Rychtecký P, Šimek K, Shabarova T (2024. május 8.). „Integrating depth-dependent protist dynamics and microbial interactions in spring succession of a freshwater reservoir”. Environ Microbiome 19, 31. o. DOI:10.1186/s40793-024-00574-5. PMID 38720385. PMC 11080224.
- ↑ a b c d e Šimek K, Grujčić V, Mukherjee I, Kasalický V, Nedoma J, Posch T, Mehrshad M, Salcher MM (2020. október 6.). „Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes”. FEMS Microbiol Ecol 96 (10), fiaa121. o. DOI:10.1093/femsec/fiaa121. PMID 32556274. PMC 7538307.
- ↑ Piwosz K, Całkiewicz J, Gołębiewski M, Creer S. „Diversity and community composition of pico- and nanoplanktonic protists in the Vistula River estuary (Gulf of Gdańsk, Baltic Sea)”. (Hozzáférés: 2024. július 31.)
- ↑ Rammel TD, Spatial and Temporal Diversity and Abundance of Cryptophytes in San Diego Coastal Waters, [[Kaliforniai Egyetem (San Diego)|]], p. 2, <https://escholarship.org/content/qt3pm0r1sp/qt3pm0r1sp_noSplash_631908032ae5bbefbf592b5a8dc383f6.pdf>. Hozzáférés ideje: 2024-07-31
- ↑ Šimek K, Mukherjee I, Szöke-Nagy T, Haber M, Salcher MM, Ghai R (2022. október 7.). „Cryptic and ubiquitous aplastidic cryptophytes are key freshwater flagellated bacterivores”. ISME J 17 (1), 84–94. o. DOI:10.1038/s41396-022-01326-4. PMID 36207492. PMC 9751141.