Klovibaktin

	Klovibaktin
	IUPAC-név
	(3S,6S,9S,13R)-12-(((2S)-2-(((2R)-6-amino-2-(((2R)-2-(((2S)-2-amino-3-fenilpropanoil)amino)-4-metilpentanoil)amino)hexanoil)amino)-3-hidroxipropanoil)amino)-9-metil-3,6-bisz(2-metilpropil)-2,5,8,11-tetraoxo-1-oxa-4,7,10-triazaciklotridekán-13-karboxamid
	Kémiai azonosítók
CAS-szám	2247194-77-8
PubChem	142449498
SMILES
	CC(C)C[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NC1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O[C@H]1C(N)=O
InChIKey	SMQAHGKBWXPEHB-MJGFNNBQSA-N
	Kémiai és fizikai tulajdonságok
Kémiai képlet	C43H70N10O11
Moláris tömeg	903,08 g/mol

A klovibaktin (Novo29) a Gram-negatív β-proteobaktérium Eleftheria terrae ssp. carolinából izolált kísérleti antibiotikum,^[1]^[2] mely a Gram-pozitív patogén baktériumok ellen észlelhető rezisztencia nélkül hat egy hidrofób felületet használva több fontos peptidoglikán-prekurzor (például undekaprenil-pirofoszfát, lipid II, lipid III_WTA) pirofoszfátcsoportjait támadja.^[1]

Történet

Bővebben: Eleftheria terrae

Az Eleftheria terrae baktériumot 2014-ben fedezték fel Maine-ben egy füves területen, ekkor azonosították az általa termelt 11 aminosavas depszipeptidet, a teixobaktint is.^[3] 2023 januárjában azonosították az általa termelt 8 aminosavas klovibaktint E. terrae ssp. carolina Δbat1 révén – a mutációra azért volt szükség, mert a vad típusú E. terrae ssp. carolina kalimantacint is termel a bat1 enzim révén.^[1] Fontos különbség köztük, hogy míg a kalimantacin nem hat a Bacillus subtilisra, a klovibaktin igen.^[1]

Bioszintézis

Shukla et al. 2023-ban bioszintézise egyik lehetséges útját is megadták, melyben először egy fenilalanin-tioészter keletkezik adenilációval és tiolációval, majd kondenzáció, adeniláció és tioláció ismétlődésével a tioésztercsoport a következő aminosavra kerül. A szerin és az aszparaginsav elhelyezése közt azonban két kondenzáció történik. Az első 6 aminosavat a cloA helyezi a peptidre, a 7.-et és a 8.-at viszont már a cloB. Ezután a cloC szállítja a cloD-hez, mely tioészterázként a peptidet gyűrűvé zárja, a tioészter pedig megszűnik.^[1]

A vegyületben 3 d-aminosav van, ezek a 2. helyen lévő leucin, a 3. helyen lévő lizin és az 5. helyen lévő hidroxiaszparagin.^[1] Ez utóbbi különösen fontos az antibiotikus aktivitáshoz.^[2]

Hatásmechanizmus

A klovibaktin több, a peptidoglikán felépítéséhez fontos prekurzor pirofoszfátcsoportját célozza a megváltoztatható részek célzása nélkül, gátolva a rezisztenciát.^[4] A teixobaktinhoz hasonlóan kizárólag baktériumokat öl el: feltehetően a lipid II-vel együtt kizárólag azok membránjain keletkező toxikus szálakat termelnek.^[5]

Jegyzetek

↑ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Shukla R, Peoples AJ, Ludwig KC, Maity S, Derks MG, de Benedetti S, Krueger AM, Vermeulen BJ, Harbig T, Lavore F, Kumar R, Honorato RV, Grein F, Nieselt K, Liu Y, Bonvin A, Baldus M, Kubitscheck U, Breukink E, Achorn C, Nitti A, Schwalen CJ, Spoering AL, Ling LL, Hughes D, Lelli M, Roos WH, Lewis K, Schneider T, Weingarth M (2023. augusztus 22.). „An antibiotic from an uncultured bacterium binds to an immutable target”. Cell 186 (19), 4059–4073.e27. o. DOI:10.1016/j.cell.2023.07.038. PMID 37611581.
↑ ^a ^b Krumberger M, Li X, Kreutzer AG, Peoples AJ, Nitti AG, Cunningham AM, Jones CR, Achorn C, Ling LL, Hughes DE, Nowick JS (2023. február 1.). „Synthesis and Stereochemical Determination of the Peptide Antibiotic Novo29”. The Journal of Organic Chemistry 88 (4), 2214–2220. o. DOI:10.1021/acs.joc.2c02648. PMID 36655882.
↑ Ling LL, Schneider T, Peoples AJ, Spoering AL, Engels I, Conlon BP, Mueller A, Schäberle TF, Hughes DE, Epstein S, Jones M, Lazarides L, Steadman VA, Cohen DR, Felix CR, Fetterman KA, Millett WP, Nitti AG, Zullo AM, Chen C, Lewis K (2015. január 7.). „A new antibiotic kills pathogens without detectable resistance”. Nature 517 (7535), 455–459. o. DOI:10.1038/nature14098. PMID 25561178.
↑ Mohana Sundaram A, Suriyamoorthy A, Vikram Singh A, Kumar S, Amin R, Emran TB (2023. december 4.). „Binding to the immutable targets: a novel strategy to combat surgical-site infections caused by multidrug-resistant superbugs”. Ann Med Surg, London 86 (1), 28–31. o. DOI:10.1097/MS9.0000000000001570. PMID 38222675.
↑ Regen SL (2024. április 16.). „Drug Design: Do Not Forget the Supramolecular Factor”. Biochemistry 63 (8), 953–957. o. DOI:10.1021/acs.biochem.3c00721. PMID 38545902.

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a Clovibactin című angol Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

[Shukla_2023-1] ↑ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Shukla R, Peoples AJ, Ludwig KC, Maity S, Derks MG, de Benedetti S, Krueger AM, Vermeulen BJ, Harbig T, Lavore F, Kumar R, Honorato RV, Grein F, Nieselt K, Liu Y, Bonvin A, Baldus M, Kubitscheck U, Breukink E, Achorn C, Nitti A, Schwalen CJ, Spoering AL, Ling LL, Hughes D, Lelli M, Roos WH, Lewis K, Schneider T, Weingarth M (2023. augusztus 22.). „An antibiotic from an uncultured bacterium binds to an immutable target”. Cell 186 (19), 4059–4073.e27. o. DOI:10.1016/j.cell.2023.07.038. PMID 37611581.

[pmid36655882-2] Krumberger M, Li X, Kreutzer AG, Peoples AJ, Nitti AG, Cunningham AM, Jones CR, Achorn C, Ling LL, Hughes DE, Nowick JS (2023. február 1.). „Synthesis and Stereochemical Determination of the Peptide Antibiotic Novo29”. The Journal of Organic Chemistry 88 (4), 2214–2220. o. DOI:10.1021/acs.joc.2c02648. PMID 36655882.

[nature-3] Ling LL, Schneider T, Peoples AJ, Spoering AL, Engels I, Conlon BP, Mueller A, Schäberle TF, Hughes DE, Epstein S, Jones M, Lazarides L, Steadman VA, Cohen DR, Felix CR, Fetterman KA, Millett WP, Nitti AG, Zullo AM, Chen C, Lewis K (2015. január 7.). „A new antibiotic kills pathogens without detectable resistance”. Nature 517 (7535), 455–459. o. DOI:10.1038/nature14098. PMID 25561178.

[Mohana_Sundaram_2023-4] Mohana Sundaram A, Suriyamoorthy A, Vikram Singh A, Kumar S, Amin R, Emran TB (2023. december 4.). „Binding to the immutable targets: a novel strategy to combat surgical-site infections caused by multidrug-resistant superbugs”. Ann Med Surg, London 86 (1), 28–31. o. DOI:10.1097/MS9.0000000000001570. PMID 38222675.

[Regen_2024-5] Regen SL (2024. április 16.). „Drug Design: Do Not Forget the Supramolecular Factor”. Biochemistry 63 (8), 953–957. o. DOI:10.1021/acs.biochem.3c00721. PMID 38545902.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]