[[1756]]-ban belépett a jezsuita rendbe, s miután Nagyszombatban elvégezte teológiai tanulmányait, a bécsi[[bécs]]i Teresianum[[Theresianum (Bécs)|Theresianum]] prefektusa lett. A rend feloszlatása ([[1773]]) után filozófiai studiumokat folytatott. [[1777]]-től a budai egyetemi könyvtár másodőre, [[1780]]-tól az egyetemen a régészet tanára, [[1794]]-től a könyvtár igazgatója, [[1802]]-től termovai apát és nagyváradi kanonok volt. Latin és német nyelvű munkái máig a magyarországi tudományos régészet alapvetésének tekinthetők; magyarországi érem- és pénzkatalógusai forrásértékűek. Schönwisner végeztette hazánkban az első tudományos ásatásokat, amelyek során többek között felfedezte [[Aquincum]]ot és ásatta Szombathelyen [[Savaria]] romjait.
