Palpitomonas bilix
A Palpitomonas bilix a Cryptista először 2010-ben leírt faja. A Cryptista többi tagjától (például Rollomonadia) korán elágazó bazális faj kloroplasztisz nélkül.[2]
 | ||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Rendszertani besorolás | ||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||
| Tudományos név | ||||||||||||||||||||
| Palpitomonas bilix Yabuki, Inagaki et Ishida 2010[1] |
Történet
szerkesztés2010-ben írták le először. Egykor a Cryptistát a Hacrobia csoportba sorolták, a Palpitomonast és a Rappemonadae csoportot lehetséges átmeneti csoportoknak tekintették.[3]
2016-ban kiderült, hogy a Hacrobia nem monofiletikus, mivel a Haptista és a Cryptista filogenetikailag távol vannak.[4]
Morfológia
szerkesztésMitokondriális cristái laposak, ez feltehetően a Cryptistában ősi jelleg. 2 mintegy 20 μm-es ostora van, az egyiken kétrészes masztigonémákkal. A Cryptista többi tagjával szemben nem rendelkezik ejektoszómákkal.[2] Sejtteste 3 μm széles, 8 μm hosszú.[5] Lassan, körkörösen mozog, sejtplazmájában vakuólumok vannak.[6] Elülső ostora élénken mozog, a hátulsó követi. Egyik ostorával a szubsztrátra rögzülhet.[6]
Életmód
szerkesztésSzabadon élő heterotróf bakterivor[6] és algivor,[7] ezen életmód fejlődéséről két feltételezést írt le Yabuki et al.: az egyik szerint a Cryptista őse mixotróf volt, és a P. bilix, a Katablepharidaceae és a Goniomonada egymástól függetlenül vesztették el fotoszintetikus képességüket, míg a másik szerint az ős heterotróf volt, a Cryptophyta fotoszintetikus képessége apomorf jellemző.[2]
A megevett zöldmoszatok klorofilljait nem alakítja nem fényérzékeny 132,173-ciklofeoforbid-enolokká (CPE), azonban már a fagoszómában megszűnik a pigmentáció.[7]
Élőhely
szerkesztésTengerekben él többek közt mikrobaszőnyegeken.[8]
Történet
szerkesztés2010-ben fedezték fel A. Yabuki, Y. Inagaki és K. Ishida.[1]
2012-ben Thomas Cavalier-Smith létrehozta a Palpitia altörzset, ennek egyetlen osztálya a Palpitea, egyetlen rendje a Palpitida, egyetlen családja a Palpitomonadidae, egyetlen nemzetsége a Palpitomonas lett.[9] Ezt Yabuki et al. 2014-es tanulmánya is alátámasztotta, ahol 157, összesen 41 372 aminosavhelyet tartalmazó gént vizsgáltak.[2]
2017-ben egy mikrobaszőnyeg 2 felső rétegében (LLA9-A-1, LLA9-B-1) is megtalálták. Ez alapján információ szerezhető a korai fotoszintetikus eukarióták evolúciójáról is.[8]
Élőhely
szerkesztésAz LLA9-A-1 és LLA
Genomika
szerkesztés2016-ban szekvenált 76 kbp-os lineáris mitokondriális genomja szerkezete levezetett: 16 kbp-os középső része egyszer szerepel, 60 kbp ellentétes irányú azonos 30 kbp-os régiókban van.[10] 6 gén, a ccmA, a ccmB, a ccmC, a ccmF, az rpl10 és az rpl2, vagyis a citokróm c-maturáz A, B, C és F alegysége mellett a 60S riboszóma L10 és L2 60S riboszóma-fehérjéi kivételével minden mitokondriális génje közös a Rhodomonas salina és a Hemiselmis andersenii mitokondriális genomjával.[10]
Az ATP-szintáz legtöbb génjével rendelkezik.[11]
A TatC mellett a TatA mitokondriális transzlokázzal is rendelkezik, ez csak kevés eukariótában található meg, például a Jakobida, az Ochrophytina és az Ancoracysta twista taxonokban.[12]
A Rheb fehérjékben feltehetően a Cryptistában jelent meg a GTPázdomén N-terminusához kapcsolódó PX domén, mely specifikusan köt foszfatidilinozit-3-foszfátot.[13]
A Microheliella marishoz hasonló szekvenciákkal is rendelkezik.[8]
GULO génnel rendelkezik több más, nem fotoszintetikus élőlényhez hasonlóan.[14]
Jelentőség
szerkesztésA Cam monofíliájának kimutatásában fontosnak bizonyultak a nem fotoszintetikus Cryptista-tagok, például a Palpitomonas bilix vagy a Katablepharidaceae.[4]
Filogenetika
szerkesztésA Palpitomonas bilix helyzete a Cam kládban:[4]
| Cam |
| ||||||||||||||||||
Jegyzetek
szerkesztés- ↑ a b Yabuki A, Inagaki Y, Ishida K (2010. október 1.). „Palpitomonas bilix gen. et sp. nov.: A novel deep-branching heterotroph possibly related to Archaeplastida or Hacrobia”. Protist 161 (4), 523–538. o. DOI:10.1016/j.protis.2010.03.001. PMID 20418156.
- ↑ a b c d Yabuki A, Kamikawa R, Ishikawa SA, Kolisko M, Kim E, Tanabe AS, Kume K, Ishida K, Inagaki Y (2014. április 10.). „Palpitomonas bilix represents a basal cryptist lineage: insight into the character evolution in Cryptista”. Sci Rep 4, 4641. o. DOI:10.1038/srep04641. PMID 24717814. PMC 3982174.
- ↑ Burki F, Okamoto N, Pombert JF, Keeling PJ (2012. június 7.). „The evolutionary history of haptophytes and cryptophytes: phylogenomic evidence for separate origins”. Proc Biol Sci 279 (1736), 2246–2254. o. DOI:10.1098/rspb.2011.2301. PMID 22298847. PMC 3321700.
- ↑ a b c Yazaki E, Yabuki A, Imaizumi A, Kume K, Hashimoto T, Inagaki Y (2022. április 13.). „The closest lineage of Archaeplastida is revealed by phylogenomics analyses that include Microheliella maris”. Open Biol 12 (4), 210376. o. DOI:10.1098/rsob.210376. PMID 35414259. PMC 9006020.
- ↑ Ruggiero MA, Gordon DP, Orrell TM, Bailly N, Bourgoin T, Brusca RC, Cavalier-Smith T, Guiry MD, Kirk PM (2015). „Higher Level Classification of All Living Organisms”. PLOS ONE 10 (4), e0119248. o. DOI:10.1371/journal.pone.0119248. PMID 25923521. PMC 4418965.
- ↑ a b c Adl SM, Bass D, Lane CE, Lukeš J, Schoch CL, Smirnov A, Agatha S, Berney C, Brown MW, Burki F, Cárdenas P, Čepička I, Chistyakova L, Del Campo J, Dunthorn M, Edvardsen B, Eglit Y, Guillou L, Hampl V, Heiss AA, Hoppenrath M, James TY, Karnkowska A, Karpov S, Kim E, Kolisko M, Kudryavtsev A, Lahr DJG, Lara E, Le Gall L, Lynn DH, Mann DG, Massana R, Mitchell EAD, Morrow C, Park JS, Pawlowski JW, Powell MJ, Richter DJ, Rueckert S, Shadwick L, Shimano S, Spiegel FW, Torruella G, Youssef N, Zlatogursky V, Zhang Q (2019. január). „Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes”. J Eukaryot Microbiol 66 (1), 4–119. o. DOI:10.1111/jeu.12691. PMID 30257078. PMC 6492006.
- ↑ a b Kashiyama Y, Yokoyama A, Shiratori T, Hess S, Not F, Bachy C, Gutierrez-Rodriguez A, Kawahara J, Suzaki T, Nakazawa M, Ishikawa T, Maruyama M, Wang M, Chen M, Gong Y, Seto K, Kagami M, Hamamoto Y, Honda D, Umetani T, Shihongi A, Kayama M, Matsuda T, Taira J, Yabuki A, Tsuchiya M, Hirakawa Y, Kawaguchi A, Nomura M, Nakamura A, Namba N, Matsumoto M, Tanaka T, Yoshino T, Higuchi R, Yamamoto A, Maruyama T, Yamaguchi A, Uzuka A, Miyagishima S, Tanifuji G, Kawachi M, Kinoshita Y, Tamiaki H (2019. február 26.). „Taming chlorophylls by early eukaryotes underpinned algal interactions and the diversification of the eukaryotes on the oxygenated Earth”. ISME J 13 (8), 1899–1910. o. DOI:10.1038/s41396-019-0377-0. PMID 30809012. PMC 6775998.
- ↑ a b c Saghaï A, Gutiérrez-Preciado A, Deschamps P, Moreira D, Bertolino P, Ragon M, López-García P (2017. május 10.). „Unveiling microbial interactions in stratified mat communities from a warm saline shallow pond”. Environ Microbiol 19( (6), 2405–2421. o. DOI:10.1111/1462-2920.13754. PMID 28489281. PMC 5554446.
- ↑ Cavalier-Smith (2015). „Multiple origins of Heliozoa from flagellate ancestors: New cryptist subphylum Corbihelia, superclass Corbistoma, and monophyly of Haptista, Cryptista, Hacrobia and Chromista”. Molecular Phylogenetics and Evolution 93, 331–362. o. DOI:10.1016/j.ympev.2015.07.004. PMID 26234272.
- ↑ a b Nishimura Y, Tanifuji G, Kamikawa R, Yabuki A, Hashimoto T, Inagaki Y (2016. október 13.). „Mitochondrial Genome of Palpitomonas bilix: Derived Genome Structure and Ancestral System for Cytochrome c Maturation”. Genome Biol Evol 8 (10), 3090–3098. o. DOI:10.1093/gbe/evw217. PMID 27604877. PMC 5174734.
- ↑ Kim JI, Yoon HS, Yi G, Shin W, Archibald JM (2018. április 20.). „Comparative mitochondrial genomics of cryptophyte algae: gene shuffling and dynamic mobile genetic elements”. BMC Genomics 19, 275. o. DOI:10.1186/s12864-018-4626-9. PMID 29678149. PMC 5910586.
- ↑ Betrů M, Wideman J, Moore K, Alcock F, Palmer T, Doležal P (2018. november 22.). „Evolution of mitochondrial TAT translocases illustrates the loss of bacterial protein transport machines in mitochondria”. BMC Biol 16, 141. o. DOI:10.1186/s12915-018-0607-3. PMID 30466434. PMC 6251230.
- ↑ Záhonová K, Petrželková R, Valach M, Yazaki E, Tikhonenkov DV, Butenko A, Janouškovec J, Hrdá Š, Klimeš V, Burger G, Inagaki Y, Keeling PJ, Hampl V, Flegontov P, Yurchenko V, Eliáš M (2018. március 27.). „Extensive molecular tinkering in the evolution of the membrane attachment mode of the Rheb GTPase”. Sci Rep 8, 5239. o. DOI:10.1038/s41598-018-23575-0. PMID 29588502. PMC 5869587.
- ↑ Wheeler G, Ishikawa T, Pornsaksit V, Smirnoff N (2015. március 13.). „Evolution of alternative biosynthetic pathways for vitamin C following plastid acquisition in photosynthetic eukaryotes”. eLife 4, e06369. o. DOI:10.7554/eLife.06369. PMID 25768426. PMC 4396506.
