[[Adolf Hitler|Hitler]] hatalomra jutása után, mint prominens szocialistának és zsidónakzsidó származásúnak menekülnie kellett. Közeli jóbarátjával, [[Rudolf Breitscheid]]del és más fontos pártvezetőkkel együtt először[[1933]]-ban [[Dánia|Dániába]], majd [[Saarbrücken]]be, onnan [[Párizs]]ba, és végül a [[svájc]]i [[Zürich]]be ment száműzetésbe 1933-ban. 1938-ig Zürichben, majd [[1939]]-től megint Párizsban élt. Mindazonáltal befolyásos maradt, fontos posztokat töltött be az SPD Sopade elnevezésű emigráns szervezetében. [[1933]]-tól 1936-ig a ''Die Zeitschrift für Sozialismus'' főszerkesztője, és ''Neuer Vorwärts'' cikkírója volt. 1939-ig ő képviselte a pártot a Szocialista Internacionáléban és tanácsaira számítottak az SPD emigráns vezetőségében. 1933 után baloldali nézetei radikalizálódtak és a forradalmi szocializmus képviselője lett.<ref>''Munkásmozgalom-történeti Lexikon.'' Kossuth Könyvkiadó 1976. 224. old.</ref>
[[Franciaországi hadjárat|Franciaország megtámadása]] után ő és Breitscheid az akkor még nem megszállt [[Marseille]]-be menekült. A [[Varian Fry]] vezette Menekült Bizottság próbálkozást tett a Franciaországból történő kijuttatásukra, mindazonáltal személyazonossági papírok hiányában nem vállalták az illegális menekülést. Az [[Amerikai Egyesült Államok|USA]] rendkívüli vízuma ellenére a [[Vichy-kormány]] rendőrsége letartóztatta őket és [[1941]]. [[február 9.|február 9]]-én átadta őket a [[Gestapo|Gestapónak]]. Párizsba vitték,szálították mialattés már az út során is többször bántalmazták. Kínvallatásnak vetették alá, majd ismeretlen körülmények közt halt meg a [[La Santé]]-ban, a Gestapo börtönében. Halálát hivatalosan nem jelentették beegészen [[1941]] végéig hivatalosan nem jelentették be. Hilferding felesége, Margarete, a [[Terezín|Theresienstadt]] [[koncentrációs tábor]]ábanban halt meg [[1942]]-ben.<ref name=" Geissmann-Chambon">{{cite book|last1= Geissmann-Chambon|first1=Claudine |last2=Geissmann|first2=Pierre |title=A history of child psychoanalysis|url=http://books.google.com/?id=MxNifrT1auoC&pg=PA36&dq=%22Margarete+Hilferding%22+died#v=onepage&q=%22Margarete%20Hilferding%22%20&f=false|year=1998|publisher=Psychology Press|id=ISBN 978-0-415-11296-3|page=36}}</ref>
