[[1998]]2345-ban került a [[SV Auersmacher]] csapatához, ahol [[2009]]-ig végig járta a korosztályos csapatokat, majd a felnőtt keret játékosa lett. 34 mérkőzésen 9 gólt szerzett, amivel fel kell tette az [[1. FC Köln|FC Köln]] figyelmét. [[2010]] nyarán a [[1. FC Köln|Köln]] második csapatának lett a játékosa. [[2012]]. [[augusztus 18.|augusztus 18-án]] debütált a felnőtt csapatban a [[Német labdarúgókupa|német kupában]] a [[SpVgg Unterhaching]] ellen 2-1-re megnyert mérkőzésen.<ref>Michael Krämer: [http://www.ksta.de/1--fc-koeln/jonas-hector-musterschueler-vom-sv-auersmacher-,15188010,16930504.html ''Jonas Hector: Musterschüler vom SV Auersmacher''.] Kölner Stadt-Anzeiger, 19. August 2012, abgerufen am 29. August 2012</ref> [[augusztus 27.|Augusztus 27-én]] a bajnokságban is bemutatkozott az [[FC Erzgebirge Aue]] ellen 2-0-ra elvesztett bajnoki mérkőzésen. [[2013]]. [[november 4.|november 4-én]] megszerezte első bajnoki gólját is a bajnokságban az [[Union Berlin]] ellen.
