Shine–Dalgarno-szekvencia

(Shine–Dalgarno szekvencia szócikkből átirányítva)

A Shine–Dalgarno-szekvencia a bakteriális RNS egy meghatározott nukleotidbázisokból álló, konszenzus része, amelyet a fehérjeszintézis transzlációs szakaszának megkezdése előtt a kapcsolódó riboszóma felismer. Riboszómális kötőhely, amely elősegíti az információ pontos fordítását. Megelőzi a start tripletet, jelzi a hollétét. Általában a start kodontól visszafelé, változóan 6-8-10 bázisnyira található. Prokariótákban nélkülözhetetlen szekvenciarészlet, archaea baktériumok, illetve mitokondriumok és kloroplasztiszok RNS-eiben is megtalálható.

JellemzőkSzerkesztés

A Shine–Dalgarno-szekvencia a prokarióta mRNS promóter szakaszának része, funkciója, hogy a „P” kötőhelyre pozicionálja az 'AUG' (start) kodont. egy puringazdag, 6 bázisos konszenzus bázissor: 'AGGAGG', ami fajtól függően minimálisan bővülhet. Ez komplementer a 16 S rRNS 3’-végének nukleotidszekvenciájával és így a hidrogénhidak kialakulása révén segíti a riboszóma kis alegységének és az mRNS-nek az összekapcsolódását. Két ausztráliai kutató: John Shine (1946–) és Lynn Dalgarno (1935–) 1975-ben fedezte fel a prokarióta promóterekre jellemző szekvenciát.

Kozak-szekvenciaSzerkesztés

Az eukarióta mRNS-en nincs Shine–Dalgarno-szekvencia, ami a P-helyre pozicionálna egy AUG kezdő kodont. Ugyanakkor Marylin Kozak nyomán van egy úgynevezett konszenzus Kozak-szekvencia, ami funkcionálisan hasonló szerepet tölt be. A különbözősége, hogy a Kozak-szekvenciának része a kezdő AUG kodon, tehát annak szekvencia környezete közvetlenül segít azonosítani a riboszóma számára, hogy melyik AUG kodont használja. Kozak-szekvencia: A/GCCACCAUGG

JegyzetekSzerkesztés

  1. Stanssens P, Remaut E, Fiers W. Alterations upstream from the Shine-Dalgarno region and their effect on bacterial gene expression. Gene. 1985;36(3):211–223. [PubMed]
  2. http://www.tankonyvtar.hu/en/tartalom/tamop425/0011_1A_Proteinbiotech_hu_book/ch01.html
  3. http://www.lifetechnologies.com/hu/en/home/references/ambion-tech-support/translation-systems/general-articles/ribosomal-binding-site-sequence-requirements.html

ForrásokSzerkesztés

  • Sarkadi Lívia: Biokémia mérnök szemmel, Budapest: Typotex, 2007 ISBN 978-963-9664-67-8
  • Boross László – Sajgó Mihály: A biokémia alapjai, Budapest: Mezőgazda Kiadó 2003, ISBN 978-963-2862-39-2
  • Shine J, Dalgarno L (1975) Determinant of cistron specificity in bacterial ribosomes. Nature 254
  • Dalgarno L, Shine J (1973) Conserved terminal sequence in 18S rRNA may represent terminator anticodons. Nature 245

Több információért lásd mégSzerkesztés